内胚葉（endoderm）は胚盤胞期の内細胞塊から形成され、原腸陥入により胚の最内層を構成します。発生4週ごろには前腸・中腸・後腸に区画化され、そこから消化器や呼吸器などの管腔臓器が発生します。
泌尿器系と生殖器系は、ともに**中胚葉（中間中胚葉）**から発生します。発生の初期には尿路と生殖の原基が隣接しており、密接に関連した構造として分化していきます。
血管は中胚葉由来で、血管新生（angiogenesis） と 血管芽生（vasculogenesis） の2つのプロセスを通じて発生します。
心臓と血管系は中胚葉由来で、胚発生のきわめて早期から形成されます。酸素や栄養の輸送に不可欠なため、ヒトの臓器の中でも最も早く機能を開始するのが心血管系です。
筋肉・骨・腱を含む筋骨格系は、主に中胚葉由来です。中胚葉は脊索の両側で**体節（ソマイト）**を形成し、そこから骨格筋や脊椎、肋骨、腱が分化していきます。四肢の骨格は側板中胚葉から派生します。
皮膚は「外胚葉由来の表皮」と「中胚葉由来の真皮」から構成されます。
毛は表皮の陥入から始まります。
毛包には「毛乳頭」「皮脂腺」「立毛筋」が付属します。
歯は「外胚葉性エナメル器」と「中胚葉性歯乳頭」から作られる複合構造です。
下垂体は二重由来の器官です。
つまり、下垂体前葉は「外胚葉由来の内分泌腺」として特別な位置づけを持ちます。
感覚器（視覚・聴覚・嗅覚）は、外胚葉から生まれる代表的な器官です。発生の初期には、神経外胚葉（神経管）と表層外胚葉が相互作用して、特殊な肥厚構造＝「プラコード（placode）」を形成します。ここから眼・耳・嗅覚の原基が出現します。
外胚葉から形成された神経管の背側に位置する細胞群が「神経堤細胞」です。神経管が閉鎖する過程で一部の細胞が遊走を始め、全身に広がります。神経堤は「第四の胚葉」と呼ばれることもあり、外胚葉の中でも非常に多様な細胞を生み出します。
これらのシグナルが複雑に組み合わさり、神経堤細胞の多様性が生まれます。
神経堤由来の異常は「神経堤疾患（Neurocristopathy）」と総称されます。代表的なものに：
これらは神経堤の移動や分化の不全が原因となります。
受精卵から発生が進むと、三胚葉が形成されます。そのうち外胚葉は「表皮」と「神経系」を生み出す重要な層です。特に 脊索（のちの脊椎の中心部になる構造）から分泌されるシグナル（Noggin, Chordin, FGF など） が、外胚葉の一部を「神経板」へと誘導します。これが神経系形成の最初のステップです。
神経管が閉じないと 二分脊椎（spina bifida）や無脳症（anencephaly） といった先天異常の原因になります。
神経管の前方（頭側）は膨らんで 3つの一次脳胞 を形成します。
その後さらに細分化され、大脳半球や視床、小脳など複雑な中枢神経が形作られます。
神経管の尾側は脊髄へと分化します。
この背腹方向のパターン化は Shh（Sonic hedgehog）とBMP（Bone Morphogenetic Protein） の濃度勾配によって決まります。
次回は、外胚葉由来のもうひとつの大きな領域である 神経堤細胞（ニューロン以外の多様な細胞群を生み出す） の発生について解説します。
外胚葉は胚の三胚葉の一つで、大きく分けると
ここでは外胚葉由来の主要器官を「中枢神経系」「神経堤由来（末梢神経系ほか）」「感覚器（眼・耳・嗅覚）」 「皮膚と付属器（毛・汗腺・乳腺等）」「歯（エナメル）」「下垂体（前葉）」に分け、各々を**起源 → 主要イベント → キーシグナル／遺伝子 → 臨床的意義（先天異常）**の流れで詳細に説明します。
神経堤は「第四の胚葉」と呼ばれるほど多様な器官を供給します。発生的には神経板の縁で生じ、折れた後に多数の細胞が遊走して分化する。